Ендоплазматична сітка (ЕПС) міститься в усіх еукаріотичних клітинах. Це система мембранних трубочок, канальці та їх потовщень, сполучених із зовнішньою цитоплазматичною мембраною та зовнішньою ядерною оболонкою. Ендоплазматична сітка бере участь у синтезі білків клітини і транспортуванні речовин всередині клітини.
Відомі два види ендоплазматичної сітки — шорстка (гранулярна), яка укрита рибосомами, що розташовуються зі сторони цитоплазми мембрани, і гладенька (негранулярна) — частина мембрани, на якій не містяться рибосоми.
Значна частина синтезованих клітиною речовин (білків, жирів, вуглеводів) не витрачається відразу, а по каналам ЕПС надходить для зберігання в особливі порожнини, укладені своєрідними колонами, «цистернами», і відмежовані від цитоплазми мембраною.
Ці порожнини отримали назву апарат (комплекс) Гольджі. Найчастіше цистерни апарату Гольджі розташовані біля ядра клітини.
У комплексі Гольджі накопичуються речовини, які клітина синтезує для потреб усього організму і які виводяться з клітини назовні. Комплекс Гольджі складається з пучків мембранних мішечків, пов'язаних з ними трубочок, які містять пухирці на кінцях.
Апарат Гольджі бере участь у перетворенні білків клітини і синтезує лізосоми — травні органели клітини.
Лізосоми є травними ферментами, які «упаковуються» у мембранні пухирці, відокремлюються і розносяться по цитоплазмі, і виконують функцію внутрішньоклітинного розщеплення макромолекул. Лізосоми містяться лише у клітинах грибів і тварин.
Вакуолі — резервуари води і розчинених у ній речовин. У рослинних клітинах є великі вакуолі, що заповнені клітинним соком, і займають значну частину об'єму клітини (до \(90\) %). У тваринних клітинах немає великих вакуолей. Проте присутні тимчасові травні, видільні та скоротливі вакуолі, які становлять до \(5\) % об'єму клітини.